MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018303	ATC	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995568
2	NC_018303	GCT	2	6	839	844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995568
3	NC_018303	ATC	2	6	1179	1184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995568
4	NC_018303	GA	3	6	1276	1281	50 %	0 %	50 %	0 %	399995568
5	NC_018303	CAAG	2	8	1297	1304	50 %	0 %	25 %	25 %	399995568
6	NC_018303	ACG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995568
7	NC_018303	CGGA	2	8	1528	1535	25 %	0 %	50 %	25 %	399995568
8	NC_018303	GC	3	6	1539	1544	0 %	0 %	50 %	50 %	399995568
9	NC_018303	GTC	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995568
10	NC_018303	ACCG	2	8	1617	1624	25 %	0 %	25 %	50 %	399995568
11	NC_018303	TCA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995568
12	NC_018303	CCG	2	6	1827	1832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995569
13	NC_018303	GAA	2	6	1878	1883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995569
14	NC_018303	TGA	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995569
15	NC_018303	T	6	6	1985	1990	0 %	100 %	0 %	0 %	399995569
16	NC_018303	GC	3	6	2032	2037	0 %	0 %	50 %	50 %	399995569
17	NC_018303	TCT	2	6	2101	2106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995569
18	NC_018303	CCTTT	2	10	2184	2193	0 %	60 %	0 %	40 %	399995570
19	NC_018303	CCG	2	6	2212	2217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995570
20	NC_018303	TCGTT	2	10	2219	2228	0 %	60 %	20 %	20 %	399995570
21	NC_018303	CGT	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995570
22	NC_018303	CGAT	2	8	2291	2298	25 %	25 %	25 %	25 %	399995570
23	NC_018303	CGA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995570
24	NC_018303	TCG	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995570
25	NC_018303	TCT	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995570
26	NC_018303	GAG	3	9	2635	2643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995570
27	NC_018303	ATC	2	6	2644	2649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995570
28	NC_018303	CGTC	2	8	2702	2709	0 %	25 %	25 %	50 %	399995570
29	NC_018303	TGT	2	6	2717	2722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995570
30	NC_018303	TCT	2	6	2802	2807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995570
31	NC_018303	CGA	2	6	2862	2867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995570
32	NC_018303	AGG	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995570
33	NC_018303	TCC	2	6	2956	2961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995570
34	NC_018303	CAT	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995570
35	NC_018303	CGAT	2	8	3000	3007	25 %	25 %	25 %	25 %	399995570
36	NC_018303	TCT	2	6	3042	3047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995570
37	NC_018303	T	7	7	3106	3112	0 %	100 %	0 %	0 %	399995570
38	NC_018303	AGG	2	6	3125	3130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995570
39	NC_018303	A	6	6	3230	3235	100 %	0 %	0 %	0 %	399995570
40	NC_018303	GAC	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995570
41	NC_018303	CGC	2	6	3270	3275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995570
42	NC_018303	CAAT	2	8	3292	3299	50 %	25 %	0 %	25 %	399995570
43	NC_018303	AGA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995570
44	NC_018303	G	6	6	3506	3511	0 %	0 %	100 %	0 %	399995570
45	NC_018303	CAA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995570
46	NC_018303	CTC	2	6	3782	3787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995570
47	NC_018303	CGAC	2	8	3882	3889	25 %	0 %	25 %	50 %	399995570
48	NC_018303	CAT	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995570
49	NC_018303	CCG	2	6	3916	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995570
50	NC_018303	TGA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995570
51	NC_018303	CT	3	6	3995	4000	0 %	50 %	0 %	50 %	399995570
52	NC_018303	TGA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995571
53	NC_018303	GGC	2	6	4234	4239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995571
54	NC_018303	TCGC	2	8	4240	4247	0 %	25 %	25 %	50 %	399995571
55	NC_018303	GAT	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995571
56	NC_018303	GCAG	2	8	4296	4303	25 %	0 %	50 %	25 %	399995571
57	NC_018303	GCG	3	9	4310	4318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995571
58	NC_018303	CG	3	6	4354	4359	0 %	0 %	50 %	50 %	399995571
59	NC_018303	CG	3	6	4373	4378	0 %	0 %	50 %	50 %	399995571
60	NC_018303	CGT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995571
61	NC_018303	CGC	2	6	4584	4589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995571
62	NC_018303	CATGC	2	10	4632	4641	20 %	20 %	20 %	40 %	399995571
63	NC_018303	CGC	2	6	4677	4682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995572
64	NC_018303	GC	3	6	4681	4686	0 %	0 %	50 %	50 %	399995572
65	NC_018303	GAT	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995572
66	NC_018303	GGCA	2	8	4875	4882	25 %	0 %	50 %	25 %	399995572
67	NC_018303	TCT	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995573
68	NC_018303	GAA	2	6	5051	5056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995573
69	NC_018303	ATTG	2	8	5196	5203	25 %	50 %	25 %	0 %	399995573
70	NC_018303	CCAGC	2	10	5220	5229	20 %	0 %	20 %	60 %	399995573
71	NC_018303	CCG	2	6	5272	5277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995573
72	NC_018303	CCCG	2	8	5280	5287	0 %	0 %	25 %	75 %	399995573
73	NC_018303	GAC	2	6	5296	5301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995573
74	NC_018303	GAT	2	6	5349	5354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995573
75	NC_018303	CCT	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995573
76	NC_018303	GCCG	2	8	5474	5481	0 %	0 %	50 %	50 %	399995573
77	NC_018303	GC	4	8	5511	5518	0 %	0 %	50 %	50 %	399995573
78	NC_018303	CGG	3	9	5528	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995573
79	NC_018303	GATTT	2	10	5545	5554	20 %	60 %	20 %	0 %	399995573
80	NC_018303	CGT	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995573
81	NC_018303	GC	3	6	5667	5672	0 %	0 %	50 %	50 %	399995573
82	NC_018303	GCC	2	6	5708	5713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995573
83	NC_018303	TTGAT	2	10	5726	5735	20 %	60 %	20 %	0 %	399995573
84	NC_018303	GC	3	6	5973	5978	0 %	0 %	50 %	50 %	399995574
85	NC_018303	CCA	2	6	6011	6016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995574
86	NC_018303	CGCTG	2	10	6078	6087	0 %	20 %	40 %	40 %	399995574
87	NC_018303	TCT	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995574
88	NC_018303	AGT	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995574
89	NC_018303	CAG	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995574
90	NC_018303	GCG	2	6	6300	6305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
91	NC_018303	AC	3	6	6306	6311	50 %	0 %	0 %	50 %	399995574
92	NC_018303	GGC	2	6	6335	6340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
93	NC_018303	CGT	2	6	6470	6475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995574
94	NC_018303	ATT	2	6	6505	6510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995574
95	NC_018303	GGC	2	6	6559	6564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
96	NC_018303	GTG	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995574
97	NC_018303	GCC	2	6	6647	6652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995574
98	NC_018303	CGG	2	6	6662	6667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
99	NC_018303	CTT	2	6	6727	6732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995574
100	NC_018303	CCA	2	6	6744	6749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995574
101	NC_018303	CA	3	6	6748	6753	50 %	0 %	0 %	50 %	399995574
102	NC_018303	TCG	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995574
103	NC_018303	GAT	2	6	6865	6870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995574
104	NC_018303	CGA	2	6	6971	6976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995574
105	NC_018303	ATCA	2	8	7292	7299	50 %	25 %	0 %	25 %	399995575
106	NC_018303	AGGA	2	8	7365	7372	50 %	0 %	50 %	0 %	399995575
107	NC_018303	GTC	2	6	7433	7438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995576
108	NC_018303	CGG	2	6	7457	7462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995576
109	NC_018303	CAG	2	6	7473	7478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995576
110	NC_018303	ATC	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995576
111	NC_018303	TCG	2	6	7530	7535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995576
112	NC_018303	CG	3	6	7534	7539	0 %	0 %	50 %	50 %	399995576
113	NC_018303	GTT	2	6	7564	7569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995576
114	NC_018303	GACGGC	2	12	7603	7614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	399995576
115	NC_018303	AGG	2	6	7623	7628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995576
116	NC_018303	AAG	2	6	7694	7699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995576
117	NC_018303	GAAG	2	8	7720	7727	50 %	0 %	50 %	0 %	399995576
118	NC_018303	A	7	7	7750	7756	100 %	0 %	0 %	0 %	399995576
119	NC_018303	GCTC	2	8	7767	7774	0 %	25 %	25 %	50 %	399995576
120	NC_018303	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	399995576
121	NC_018303	CCAGAG	2	12	7868	7879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995577
122	NC_018303	CGCC	2	8	7882	7889	0 %	0 %	25 %	75 %	399995577
123	NC_018303	TGG	2	6	7908	7913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995577
124	NC_018303	TGA	2	6	8037	8042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995577
125	NC_018303	CTG	3	9	8054	8062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995577
126	NC_018303	GAT	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995577
127	NC_018303	ACG	2	6	8097	8102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995577
128	NC_018303	ACA	2	6	8166	8171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995577
129	NC_018303	CTG	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995577
130	NC_018303	CCA	2	6	8235	8240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995577
131	NC_018303	TGC	2	6	8385	8390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995577
132	NC_018303	ACG	2	6	8414	8419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995577
133	NC_018303	CCG	2	6	8432	8437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995577
134	NC_018303	ACA	2	6	8537	8542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995577
135	NC_018303	CGA	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995578
136	NC_018303	GCA	2	6	8978	8983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995578
137	NC_018303	CGA	2	6	8989	8994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995578
138	NC_018303	GTC	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995578
139	NC_018303	GGC	2	6	9087	9092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995578
140	NC_018303	TGT	2	6	9109	9114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995578
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143	NC_018303	TCG	2	6	9393	9398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995579
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148	NC_018303	GTC	2	6	9566	9571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995579
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261	NC_018303	GTC	2	6	17354	17359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995587
262	NC_018303	ACG	2	6	17373	17378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995587
263	NC_018303	TCG	2	6	17394	17399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995587
264	NC_018303	ACG	2	6	17421	17426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995587
265	NC_018303	GAT	2	6	17483	17488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995587
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267	NC_018303	GGC	2	6	17951	17956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995588
268	NC_018303	CGGC	2	8	18053	18060	0 %	0 %	50 %	50 %	399995588
269	NC_018303	TGAT	2	8	18103	18110	25 %	50 %	25 %	0 %	399995588
270	NC_018303	GTG	2	6	18111	18116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995588
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273	NC_018303	TAT	2	6	18243	18248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995588
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277	NC_018303	TCT	2	6	18578	18583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995589
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388	NC_018303	GAT	2	6	25529	25534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995596
389	NC_018303	TCG	2	6	25555	25560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995596
390	NC_018303	CCG	2	6	25604	25609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995596
391	NC_018303	TCA	2	6	25888	25893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995597
392	NC_018303	GCT	2	6	25986	25991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995597
393	NC_018303	TTG	2	6	25998	26003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995597
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427	NC_018303	TCC	2	6	28305	28310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995602
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497	NC_018303	C	6	6	31253	31258	0 %	0 %	0 %	100 %	399995606
498	NC_018303	GAT	2	6	31289	31294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995606
499	NC_018303	GAT	2	6	31313	31318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995606
500	NC_018303	ACG	2	6	31326	31331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995606

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